MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 1709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015423	GTG	2	6	66823	66828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015423	CG	3	6	66857	66862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_015423	CAC	2	6	66874	66879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_015423	TCG	2	6	66896	66901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_015423	CCGG	2	8	66914	66921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_015423	CGA	2	6	67057	67062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_015423	TGG	2	6	67069	67074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015423	CCCCG	2	10	67197	67206	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1509	NC_015423	GAA	2	6	67235	67240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015423	T	6	6	67272	67277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015423	TGA	2	6	67336	67341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015423	CAGAC	2	10	67371	67380	40 %	0 %	20 %	40 %	330827403
1513	NC_015423	ACA	2	6	67463	67468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827403
1514	NC_015423	GGC	2	6	67524	67529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1515	NC_015423	CCT	2	6	67596	67601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330827403
1516	NC_015423	GCG	2	6	67613	67618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1517	NC_015423	CGA	2	6	67626	67631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827403
1518	NC_015423	GC	3	6	67650	67655	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1519	NC_015423	GAG	2	6	67657	67662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827403
1520	NC_015423	GC	3	6	67695	67700	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1521	NC_015423	CAGCG	2	10	67710	67719	20 %	0 %	40 %	40 %	330827403
1522	NC_015423	GCCGT	2	10	67835	67844	0 %	20 %	40 %	40 %	330827403
1523	NC_015423	AGC	2	6	67874	67879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827403
1524	NC_015423	GC	3	6	67878	67883	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1525	NC_015423	CCGT	2	8	67925	67932	0 %	25 %	25 %	50 %	330827403
1526	NC_015423	CGC	2	6	67936	67941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1527	NC_015423	GCA	2	6	67979	67984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827403
1528	NC_015423	CGAG	2	8	68031	68038	25 %	0 %	50 %	25 %	330827403
1529	NC_015423	GCTG	2	8	68084	68091	0 %	25 %	50 %	25 %	330827403
1530	NC_015423	AAGG	2	8	68104	68111	50 %	0 %	50 %	0 %	330827403
1531	NC_015423	ACG	2	6	68147	68152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827403
1532	NC_015423	CGCGC	2	10	68181	68190	0 %	0 %	40 %	60 %	330827403
1533	NC_015423	GCC	2	6	68212	68217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1534	NC_015423	AAG	2	6	68218	68223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827403
1535	NC_015423	GC	3	6	68292	68297	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1536	NC_015423	GGC	2	6	68314	68319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1537	NC_015423	GGC	2	6	68350	68355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1538	NC_015423	TGG	2	6	68381	68386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827403
1539	NC_015423	CAA	2	6	68397	68402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827403
1540	NC_015423	GGC	2	6	68407	68412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1541	NC_015423	TGCGCG	2	12	68447	68458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330827403
1542	NC_015423	CG	3	6	68482	68487	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1543	NC_015423	CCGA	2	8	68488	68495	25 %	0 %	25 %	50 %	330827403
1544	NC_015423	CGC	2	6	68502	68507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1545	NC_015423	AAG	2	6	68515	68520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827403
1546	NC_015423	GCC	2	6	68521	68526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1547	NC_015423	GCC	2	6	68532	68537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1548	NC_015423	CCG	2	6	68576	68581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1549	NC_015423	CCG	2	6	68600	68605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1550	NC_015423	TACCGC	2	12	68653	68664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330827403
1551	NC_015423	GCC	2	6	68749	68754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1552	NC_015423	GGCCCC	2	12	68784	68795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1553	NC_015423	CCGCG	2	10	68841	68850	0 %	0 %	40 %	60 %	330827403
1554	NC_015423	CG	3	6	68946	68951	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1555	NC_015423	CCGG	2	8	69011	69018	0 %	0 %	50 %	50 %	330827403
1556	NC_015423	GTG	2	6	69049	69054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827403
1557	NC_015423	GCC	2	6	69083	69088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1558	NC_015423	CCG	2	6	69099	69104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1559	NC_015423	GTG	2	6	69109	69114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827403
1560	NC_015423	TGA	2	6	69173	69178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827403
1561	NC_015423	CGA	2	6	69198	69203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827403
1562	NC_015423	GGC	2	6	69244	69249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1563	NC_015423	CCGC	2	8	69297	69304	0 %	0 %	25 %	75 %	330827403
1564	NC_015423	TGG	2	6	69305	69310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827403
1565	NC_015423	AGC	2	6	69311	69316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827403
1566	NC_015423	CGG	2	6	69318	69323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827403
1567	NC_015423	C	6	6	69340	69345	0 %	0 %	0 %	100 %	330827403
1568	NC_015423	CCG	2	6	69368	69373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
1569	NC_015423	ACGC	2	8	69413	69420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_015423	CTG	2	6	69489	69494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827404
1571	NC_015423	CAA	2	6	69527	69532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827404
1572	NC_015423	GCC	2	6	69537	69542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827404
1573	NC_015423	GC	3	6	69587	69592	0 %	0 %	50 %	50 %	330827404
1574	NC_015423	GCCGC	2	10	69607	69616	0 %	0 %	40 %	60 %	330827404
1575	NC_015423	CTG	2	6	69618	69623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827404
1576	NC_015423	GCC	2	6	69678	69683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827404
1577	NC_015423	CCCG	2	8	69701	69708	0 %	0 %	25 %	75 %	330827404
1578	NC_015423	GC	3	6	69743	69748	0 %	0 %	50 %	50 %	330827404
1579	NC_015423	TGC	2	6	69778	69783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827404
1580	NC_015423	GCA	2	6	69812	69817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827404
1581	NC_015423	GAA	2	6	69843	69848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827404
1582	NC_015423	GC	3	6	69851	69856	0 %	0 %	50 %	50 %	330827404
1583	NC_015423	TGG	2	6	69879	69884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827404
1584	NC_015423	GCT	2	6	69902	69907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827404
1585	NC_015423	GGC	2	6	69932	69937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015423	GCC	2	6	69958	69963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827405
1587	NC_015423	TGG	2	6	69968	69973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827405
1588	NC_015423	CCG	2	6	69974	69979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827405
1589	NC_015423	ACG	2	6	70214	70219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827405
1590	NC_015423	AAC	2	6	70237	70242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827405
1591	NC_015423	GC	3	6	70250	70255	0 %	0 %	50 %	50 %	330827405
1592	NC_015423	GGA	2	6	70332	70337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827405
1593	NC_015423	T	6	6	70382	70387	0 %	100 %	0 %	0 %	330827405
1594	NC_015423	CG	3	6	70392	70397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_015423	GCC	2	6	70398	70403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_015423	GGC	2	6	70408	70413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_015423	CTA	2	6	70428	70433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827406
1598	NC_015423	CGC	2	6	70480	70485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827406
1599	NC_015423	GCC	2	6	70553	70558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827406
1600	NC_015423	CTG	2	6	70571	70576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827406
1601	NC_015423	TGC	2	6	70591	70596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827406
1602	NC_015423	GGC	2	6	70612	70617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827406
1603	NC_015423	AGGGC	2	10	70684	70693	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1604	NC_015423	CTG	2	6	70700	70705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_015423	GC	3	6	70723	70728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_015423	GC	3	6	70730	70735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_015423	TCCT	2	8	70751	70758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_015423	GCT	3	9	70765	70773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015423	TCT	2	6	70785	70790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_015423	CT	4	8	70805	70812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_015423	GCT	2	6	70877	70882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015423	CTG	2	6	70923	70928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_015423	CG	4	8	70996	71003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_015423	GTG	2	6	71032	71037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015423	GTTC	2	8	71078	71085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_015423	GC	3	6	71101	71106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_015423	GGCG	2	8	71110	71117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_015423	CGCTG	2	10	71148	71157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1619	NC_015423	CATGA	2	10	71205	71214	40 %	20 %	20 %	20 %	330827407
1620	NC_015423	GAC	2	6	71244	71249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827407
1621	NC_015423	GCC	2	6	71292	71297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827407
1622	NC_015423	CTT	2	6	71363	71368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330827407
1623	NC_015423	CG	3	6	71491	71496	0 %	0 %	50 %	50 %	330827407
1624	NC_015423	GGT	2	6	71498	71503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827407
1625	NC_015423	CGC	3	9	71525	71533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827407
1626	NC_015423	ACC	2	6	71551	71556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827407
1627	NC_015423	TGG	2	6	71626	71631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827407
1628	NC_015423	CGT	3	9	71651	71659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827407
1629	NC_015423	CGG	2	6	71663	71668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827407
1630	NC_015423	CTG	2	6	71697	71702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827407
1631	NC_015423	GAGC	2	8	71880	71887	25 %	0 %	50 %	25 %	330827408
1632	NC_015423	A	7	7	71966	71972	100 %	0 %	0 %	0 %	330827408
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1662	NC_015423	GC	3	6	73198	73203	0 %	0 %	50 %	50 %	330827411
1663	NC_015423	CGG	2	6	73245	73250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827411
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1669	NC_015423	TGG	2	6	73544	73549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1672	NC_015423	GCT	2	6	73709	73714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1673	NC_015423	GCC	2	6	73762	73767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1674	NC_015423	CGG	2	6	73771	73776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1709	NC_015423	GC	3	6	75416	75421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.